Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Grin2bQ01097 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms