Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Pkp1P97350 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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