Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rps29P62274 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms