Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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