Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxrbP28704 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms