Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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