Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms