Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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