Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nudt21Q9CQF3 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nudt21Q9CQF3 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms