Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Trim12aQ99PQ1 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Trim12aQ99PQ1 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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