Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprtQ99M80 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms