Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Snx8Q8CFD4 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms