Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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