Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms