Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ctdnep1Q3TP92 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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