Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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