Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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