Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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SrprbP47758 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
SrprbP47758 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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