Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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