Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxrgP28705 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms