Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.4 ms