Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms