Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sp100O35892 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sp100O35892 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sp100O35892 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sp100O35892 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sp100O35892 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sp100O35892 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sp100O35892 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sp100O35892 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms