Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp9yF8VPU6 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.8 ms