Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Spocd1B1ASB6 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms