Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Speer3W4VSP1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms