Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5493S4R2D1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5493S4R2D1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms