Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms