Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt16Q9Z2K1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt16Q9Z2K1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms