Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd2Q9Z2E1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms