Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms