Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tulp1Q9Z273 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms