Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn7Q9Z261 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn7Q9Z261 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms