Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ilf3Q9Z1X4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms