Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lgr5Q9Z1P4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms