Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms