Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sumo3Q9Z172 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sumo3Q9Z172 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms