Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne6Q9Z140 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms