Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp2Q9Z0Z3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms