Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cldn13Q9Z0S4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cldn13Q9Z0S4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn13Q9Z0S4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms