Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncgQ9Z0F7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncgQ9Z0F7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms