Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapaQ9WV55 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms