Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FarsbQ9WUA2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FarsbQ9WUA2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms