Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6cQ9WTM3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms