Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms