Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubd1Q9R1K7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubd1Q9R1K7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms