Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slit2Q9R1B9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slit2Q9R1B9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slit2Q9R1B9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slit2Q9R1B9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slit2Q9R1B9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slit2Q9R1B9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit2Q9R1B9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms