Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4eQ9R0Q8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4eQ9R0Q8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms