Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed2Q9R0Q3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms