Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt6Q9R0N8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt6Q9R0N8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms